ไอแพดรุ่นใหม่ใช้ระบบปฏิบัติการ iOS 5.1 ซึ่งเปิดตัวพร้อมกันในวันที่ 7 มีนาคม พ.ศ. 2555[4] มาพร้อมกับกล้อง iSight ความละเอียด 5 ล้านพิกเซล ทำให้ผู้ใช้สามารถถ่ายภาพถ่ายคุณภาพสูงและแบ่งปันบนโลกออนไลน์ได้ทันที[5] ไอแพดรุ่นใหม่นี้ยังสนับสนุนโปรแกรม GarageBand, iMovie และโปรแกรมชุด iWork ได้แก่ Pages, Keynote และ Numbers ได้เช่นเดิม รวมทั้งโปรแกรมใหม่อย่าง iPhoto ด้วย[6] โปรแกรมเหล่านี้ไม่ได้ติดตั้งมาพร้อมกับเครื่อง แต่ผู้ใช้จะต้องดาวน์โหลดจากแอปเปิลผ่านทางแอพสโตร์